非公開で、敢えてハッシュタグを付けると言うのは矛盾してると思いますが。公開されてしまいます。

チャンネルはただのハッシュタグの集まりであって、そこには公開範囲などの要素は持っておりません。

ただ、TL表示、チャンネル表示、サークル表示、それぞれ別扱いされますので、それぞれ削除することはできます。

たとえば、非公開サークルでハッシュタグ付きでツイートした場合、TL、チャンネルにもそれぞれ表示されますが、削除することは出来ます。それぞれ削除しても、サークルに書き込んだものはそのまま残ります。ただ、その場合、編集をすると再度チャンネルに表示されることになります。